독립 연구 프로그램
그동안 학술적으로 다루어지기 힘들었던, 근원적인 문제들, 또 복합적인 초학제적 주제들을 보다 심층적으로 연구하여 학술적 성과로까지 연결시키고자 하는 프로그램이다. 각 독립연구단은 책임연구원과 공동연구원으로 구성하고, 연구단마다 고등과학원에 상주하는 연구원을 둔다. 2013년 현재 패러다임-독립연구단과 정보-독립연구단 이상 2개팀이 활동중에 있다.